在一些支原體檢測過程中,如果PCR反應(yīng)不穩(wěn)定,存在PCR擴(kuò)增污染和誤差的可能,則需要用到Ung酶。
在支原體的檢測中,Ung酶(尿嘧啶DNA糖苷酶)通常用于防止PCR擴(kuò)增中的污染和誤差。這是通過Ung酶的能力來切除PCR反應(yīng)中的尿嘧啶來實現(xiàn)的。以下是支原體檢測中Ung酶的一般應(yīng)用步驟:
設(shè)計引物: 針對支原體的DNA,設(shè)計PCR引物。這些引物將用于擴(kuò)增支原體的DNA片段。
PCR反應(yīng): 執(zhí)行PCR反應(yīng),包括支原體DNA和引物,以擴(kuò)增目標(biāo)DNA。在PCR反應(yīng)中,通常會添加dUTP(脫氧尿嘧啶三磷酸)代替常規(guī)的dATP。這樣,擴(kuò)增得到的DNA鏈中包含尿嘧啶,而不是腺嘧啶。
Ung酶處理: 在PCR反應(yīng)后,加入Ung酶。Ung酶能夠識別和切除PCR產(chǎn)物中的尿嘧啶,形成AP位點(腺苷酸(A)和磷酸(P)的殘基)。這個步驟有助于防止污染,因為Ung酶會切除在PCR反應(yīng)中引入的任何尿嘧啶,從而防止PCR產(chǎn)物的再擴(kuò)增。
熱激活Ung酶: 在Ung酶處理之后,進(jìn)行一個熱激活步驟,將Ung酶活性失活。這通常包括一個較高的溫度步驟,以確保Ung酶不會影響之后的PCR反應(yīng)。
進(jìn)行第二輪PCR: 將經(jīng)過Ung酶處理的PCR產(chǎn)物作為模板進(jìn)行第二輪PCR。由于Ung酶處理,尿嘧啶已被切除,避免了尿嘧啶在PCR反應(yīng)中引入的錯誤。
通過引入Ung酶,可以有效地降低PCR反應(yīng)的假陽性率,提高檢測的特異性。這樣的設(shè)計有助于確保支原體檢測的準(zhǔn)確性和可靠性。