支原體污染是細(xì)胞培養(yǎng)實驗中,較為常見又十分棘手的問題。日常實驗中,需要對細(xì)胞培養(yǎng)環(huán)境定期清潔;對細(xì)胞培養(yǎng)上清液、培養(yǎng)基和生物制藥生產(chǎn)環(huán)節(jié)進(jìn)行的支原體污染監(jiān)測。尋找一種快速、可靠和節(jié)省時間的常規(guī)監(jiān)測手段對于提高實驗效率、維持實驗結(jié)果的穩(wěn)定十分重要。
德國Minerva Biolabs公司生產(chǎn)的Venor®GeM經(jīng)典試劑盒,為檢測細(xì)胞培養(yǎng)物和其他生物基質(zhì)中支原體而設(shè)計。基于傳統(tǒng)PCR方法,可實現(xiàn)快速、穩(wěn)健、高靈敏度的支原體污染檢測。
產(chǎn)品名稱:支原體常規(guī)PCR檢測試劑盒
英文:Venor® Gem Classic
品牌:Minerva-Biolabs®
貨號:11-1025
規(guī)格:25次/盒
產(chǎn)品特點及原理
該試劑盒針對支原體基因組中的一個高度保守區(qū)域:16s rRNA編碼區(qū),以檢測歐洲藥典第2.6.7章(EP 2.6.7)、日本藥典第G3章(JP G3)和更多物種中包含的所有物種,根據(jù)支原體種類的不同,擴增子的大小在265-278 bp之間。
試劑盒設(shè)計滿足EP 2.6.7和JP G3不同樣品材料(如細(xì)胞培養(yǎng)上清、細(xì)胞培養(yǎng)基、Tris緩沖液)的檢測標(biāo)準(zhǔn)。該檢測方法適用于通常用于研究的細(xì)胞培養(yǎng)上清、“細(xì)胞培養(yǎng)富集"方法或DNA提取后的支原體直接檢測。該試劑盒符合EP 2.6.7和JP G3的要求。
整個測試僅需要3小時左右的時間,并且與基于發(fā)光的酶測定、熒光染色或培養(yǎng)方法相比,不需要活的支原體細(xì)胞。
使用方法詳解
預(yù)處理
一、普通細(xì)胞培養(yǎng)物的預(yù)處理
當(dāng)細(xì)胞培養(yǎng)達(dá)到80% - 90%的融合度時,收集樣品。細(xì)胞培養(yǎng)上清液非常適合支原體試驗,不需要額外的樣品制備。
細(xì)胞培養(yǎng)中支原體的平均滴度為10^6-10^8顆粒/ ml。在此范圍內(nèi),上清液中存在足夠數(shù)量的支原體DNA,可以成功應(yīng)用PCR檢測。
1. 從細(xì)胞培養(yǎng)液中取100µl上清至1.5 ml反應(yīng)管中。把蓋子蓋緊。
2. 將樣品上清液在95℃下孵育10分鐘(至少5分鐘)。
3.以最大轉(zhuǎn)速離心樣品。15秒的速度使細(xì)胞碎片成顆粒。
4. 直接使用2µl進(jìn)行PCR,或在+2至+8°C或≤- 18°C下長期保存樣品6天。
二、.生物藥或需遵循藥典的預(yù)處理
1、樣品富集
(可根據(jù)實際情況選做)
對于樣品體積> 200µl,建議采用樣品富集的方法以獲得最佳靈敏度。請注意,樣品濃度方案只適用于完整的支原體細(xì)胞。
因此,在樣品濃縮之前,必須避免任何破壞細(xì)胞的程序(例如通過熱失活)??芍苯犹幚?00µl體積的樣品,無需樣品
濃度的一步。
① 將最多1ml樣品上清液轉(zhuǎn)移到1.5 ml反應(yīng)管中。
② ≥10,000 x g離心15分鐘(或≥13,000 x g離心6分鐘),使支原體顆粒成球。
③丟棄上清,用200µl Tris緩沖液(10 mM Tris- hcl, pH 8.4)重懸小球。
④使樣品短暫旋轉(zhuǎn),然后立即進(jìn)行樣品穩(wěn)定或DNA提取。
2、樣品預(yù)穩(wěn)定
(可根據(jù)實驗需求選做)
細(xì)胞培養(yǎng)樣品可能含有高濃度的DNA酶,即使在低溫下也會降解支原體DNA。因此,我們建議采取以下步驟來穩(wěn)定樣品。如果在樣品采集后立即進(jìn)行DNA提取,則可以省略此步驟。
①從細(xì)胞培養(yǎng)液中取500µl上清轉(zhuǎn)移到1.5 ml反應(yīng)管中。把蓋子蓋緊。
②樣品在95°C下孵育10分鐘。
③以最大轉(zhuǎn)速離心樣品。速度短暫(15秒),以顆粒細(xì)胞碎片。
④用樣本提取DNA。在+2至+8°C或≤- 18°C的條件下長期保存樣品,最長可保存6天。
3.DNA提取
大量證據(jù)表明,需要提取DNA才能達(dá)到比較高的靈敏度。許多DNA提取方法建立了各種各樣的樣品材料。然而,DNA提取方法必須與支原體和樣品特異性相適應(yīng)。對于EP和jp兼容的測試,DNA提取方法必須與PCR試劑盒結(jié)合進(jìn)行測試。我們推薦Venor®GeM樣品制備試劑盒(Cat:56 - 1010 / -1050/-1200)。該DNA提取試劑盒為此目的進(jìn)行了廣泛的測試。
PCR過程
一、準(zhǔn)備PCR試劑
二、配制反應(yīng)體系
普通細(xì)胞培養(yǎng)物
14.5 µl 水
2.5 µl 10×緩沖液
2.5 µl 引物/dNTP溶液
2.5 µl 內(nèi)控
1.0 µl Taq酶 (1 unit)
每個PCR管移液23µl,丟棄剩余材料,使反應(yīng)混合物渦旋5秒。
生物藥或需遵循藥典的樣本
體系包含:
6.5 µl 水
2.5 µl 10×緩沖液
2.5 µl 引物/dNTP溶液
2.5 µl 內(nèi)控
1.0 µl Taq酶 (1 unit)
每個PCR管移液23µl,丟棄剩余材料,使反應(yīng)混合物渦旋5秒。
三、加樣
在配制好的反應(yīng)體系中,分別加入陰性(無模板對照,NTC)對照、陽性對照、樣品.
普通細(xì)胞培養(yǎng)物
陰性對照:加入2µl PCR級水(白色帽)。
樣品:加入細(xì)胞培養(yǎng)上清或DNA提取液2µl。
陽性對照:加入2µl陽性對照DNA(綠色帽)。
關(guān)閉并渦旋所有PCR管,加載PCR儀并啟動程序。
生物藥或需遵循藥典的樣本
陰性對照:加入10µl PCR級水(白色帽)。
樣品:加入DNA提取液10µl。
陽性對照:加入2µl陽性對照DNA(綠色帽)。
關(guān)閉并渦旋所有PCR管,加載PCR儀并啟動程序。
四、開始擴增
將PCR管放入PCR儀并蓋緊蓋子,按照下圖中的程序設(shè)置PCR儀,并開始程序。
五、瓊脂糖凝膠電泳與結(jié)果分析
注意事項
?由于細(xì)胞碎片對PCR反應(yīng)的負(fù)面影響,不能直接使用細(xì)胞團(tuán)進(jìn)行檢測。細(xì)胞顆粒、胎牛血清(FCS> 5%)、疫苗、冷凍儲存和石蠟包埋樣品,在PCR前需要提取DNA。Venor®GeM經(jīng)典試劑盒使用Venor®GeM樣品制備試劑盒(Cat.56-1010/-1050/-1200)進(jìn)行DNA提取。提取的DNA可在+2至+8°C下保存6天。長期儲存必須在≤- 18°C。
?培養(yǎng)基中的青霉素或鏈霉素不抑制支原體,也不影響試驗的敏感性。
?不建議將不同批號的試劑混合使用。試劑盒中的試劑如果超過保質(zhì)期,也不建議使用。
?嚴(yán)格遵守實驗操作規(guī)范。任何偏差都可能影響測試方法和結(jié)果。
?如果提取DNA,使用新鮮的細(xì)胞培養(yǎng)基或洗脫緩沖液作為陰性對照。
?在陰性對照和測試反應(yīng)后準(zhǔn)備陽性對照,避免交叉污染。PCR抑制可能是由樣品基質(zhì)引起的,或者在提取DNA的情況下,由洗脫緩沖液引起的。因此,我們推薦Venor®GeM樣品制備試劑盒。任何其他DNA提取試劑盒都需要驗證。